00開頭的股票和60開頭的股票其區別在于：

1、00開頭的股票是深交所主板上市的股票；而60開頭的股票是上交所主板上市的股票。

2、上交所60開頭的股票上市首日，盤中成交價較前收盤價首次上漲或下跌達到或超過20%的，臨時停牌時間為30分；而深交所的股票上市首日不設置臨停制度。

3、持有00開頭的股票可以申購深交所的新股，如果開通創業板權限，還可以申購創業板的新股；持有60開頭的股票可以申購上交所主板上市的新股，如果開通科創板權限，還可以申購科創板的新股。申購新股時：滬市 1000股=1個配號、科創板500股=1個配號、深市 500股=1個配號。

以上是二者交易規則上的不同，二者還有上市要求不同，一般上交所上市更為嚴格。