機動車損失險保額一般是按照以下方式進行計算的：

1.按照新車購置價計算，為足額投保，出險時，被保險人可以獲得實際損失的賠付；

2.按照投保時車輛的實際價值（新車購置價-折舊金額）計算保額，為不足額投保，車輛出險后，保險公司可按照實際價值和新車價格之比進行理賠；

3.投保人和保險公司協商計算保額，一般發生在稀有車型或罰沒車型上，因為稀有車型價格在市場上鮮有對比性，價值又較高，而罰沒車型價值又比較低。