網聯支付寶協議付款指支付寶與網聯清算有限公司達成合作，開展條碼支付的業務合作。各個收單機構的對接主體將從支付寶變為網聯，付款時將由網聯清算之后再對接到支付寶。這個改變的只是交易鏈路，用戶和商家使用支付寶的支付體驗不會受到任何影響。

用戶只需向支付公司提供姓名、身份證號、銀行卡號以及手機號和驗證碼即可。支付公司會將用戶的這些信息交給銀行鑒權，若銀行鑒權成功，則會形成一個協議編號，當用戶支付時提供編號即可。網聯協議支付適用于小貸業務的分期還款、壽險保費續繳納等多次支付的業務場景。

央行成立網聯支付，微信支付等第三方平臺不能直接對接銀行。網聯的全稱是非銀行支付機構網絡支付清算平臺，被稱為網絡版銀聯，受央行指導監管。主要面向支付寶、財付通等非銀行的第三方支付機構，為其提供統一的清算服務。簡單舉個例子，從支付寶賬戶提現到銀行卡，交易的數據是通過支付寶——網聯——銀行這樣的鏈條走的。主要改變在于：算賬的時候，所有跟銀行賬戶有關的資金流動數據央行都能看得見。

目前，業內大部分的第三方支付機構基本已接入網聯或者銀聯系統，有些機構是兩家清算機構都接入了。