跨行ATM機不可以存錢。通過ATM機還是通過銀行柜臺都是不支持跨行存錢的。想實現跨行存款，跨行轉賬會收取相應的手續費用，可到對應的銀行網點進行存款，同行存款是不收取任何費用的。ATM銀行與銀行之間沒有開通存款相容的業務，所以ATM只能本行存本行的，有些銀行ATM也不能跨省跨地區存錢，只能存本地區的。

中國銀聯2015年6月8日宣布，ATM跨行轉賬業務已在全國所有銀行開通，持卡人可在任意銀行ATM機上，用任何一張銀聯卡向其它銀聯卡跨行轉賬，限額是每天5萬元。目前大部分銀行ATM機跨行轉賬收費標準，比柜臺轉賬略低，但比網銀、手機銀行轉賬收費要高。其實銀行間不想開通跨行存款也是有很大原因的，每個銀行都想讓儲戶在自己的銀行存錢，如果這個業務開通了，會流失一大筆資金。取錢的手續費是按照筆數收取，而不是按照金額比例收取，有的是每筆1元，有的每筆2元。轉賬費用按照金額分檔次收取，各家銀行規定不一。