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如何使用IMGT/V-QUEST,分析雞抗體基因序列

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如何批量下載IMGT/HLA數據庫 的序列?

  首先到JGI主頁,選擇一個物種,然后用Key Words search,或者Blast,找到目的序列。
  點這個目的序列。
  會出現一排目錄,一個基因,一般是About this gene, Sequences,peptide Homologs, Gene Ancestry, Get Data,點Sequences。

IMGT網站比對方法

  根據IMGT網站上氨基酸的性質,按照氨基酸的疏水性排列,然后通過SUMIF函數,按照新的氨基酸排序方式計算每一種氨基酸的使用頻率。
  

為什么用IMGT和用NCBI中的igblast對單克隆抗體的分析獲得不同的結果_百

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